La Prefectura es, en suma, la Autoridad Marítima Argentina por excelencia, por la multiplicidad de circunstancias generales y específicas que abarcan sus responsabilidades y en mérito a la legislación que reiteradamente lo expresa, definiendo nítidamente su perfil institucional en el concierto de los organismos del Estado.
El 29 de octubre de 1896 fue promulgada la ley 3.445, marco legal que, por su data, atestigua la antigüedad de la institución.